Le catalogue Farnèse fait peau neuve à l’été 2021 avec le choix du prestataire Ex-Libris et de son catalogue Primo.

Mis en ligne en 2008, le catalogue Farnèse agrège les références bibliographiques des bibliothèques de trois institutions : l’École française de Rome, l’Académie de France à Rome - Villa Médicis et le Centre Jean Bérard de Naples.

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La collection de la bibliothèque de l'EFR est intégrée, depuis mai 2008, dans le catalogue collectif universitaire français SUDOC, on y trouve la plupart des abonnements en cours, et, depuis octobre 2015, dans le catalogue collectif URBiS, qui regroupe les principales bibliothèques d’instituts internationaux à Rome.